| MirGeneDB ID | Dno-Mir-2114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2114 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-2114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-2114 Cja-Mir-2114 Eca-Mir-2114 Hsa-Mir-2114 Laf-Mir-2114 Mml-Mir-2114 Pab-Mir-2114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH562324: 969560-969619 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2114) |
Mir-12086
JH562324: 969379-969437 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-2114 JH562324: 969560-969619 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AGUCCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUGAGACCAGCCCACGGCCUCCAUGCUCCUAGUCCCUUCCUUGAAGCCGUCGGAUAAGCCACAUGACGAGCCUCAAGCAAGGGACUUAGAGCUGCUGGCUUCCAGCAGCUUCCUGCUCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACUGAGACCAGCCCACG---| UC U CU C A - GGAUAA GCC CA GCUC AGUCCCUU CUUGA GC CGUC \ CGG GU CGAG UCAGGGAA GAACU CG GCAG G CCUCGUCCUUCGACGACCUU^ UC - AU C C A UACACC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-2114_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGUCCCUUCCUUGAAGCCGUC -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dno-Mir-2114_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CGAGCCUCAAGCAAGGGACUUAG -60
Get sequence
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