| MirGeneDB ID | Dno-Mir-12086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12086 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-12086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. novemcinctus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. novemcinctus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH562324: 969379-969437 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12086) |
Mir-12086
JH562324: 969379-969437 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-2114 JH562324: 969560-969619 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UUUCGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAGGCAGGGGCACAGGCCUCCUGGGUCUGCUUUCGGCGCCUAGGAUUCGGUGAAAGCUCGAGUGACAGAAUCCUAGAGCUGAAAAGCACCUCAAGAAGCCAUCGGUCCAACCCUGUUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAGGCAGGGGCACAGGCC---| C UC - GC G GAAAGC UC UGGG UGCUUU CGGC CUAGGAUUC GU \ AG ACUC ACGAAA GUCG GAUCCUAAG CA U UUUGUCCCAACCUGGCUACCGA^ A C- A A- A GUGAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-12086_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUUCGGCGCCUAGGAUUCGGU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-12086_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AGAAUCCUAGAGCUGAAAAGCA -59
Get sequence
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