| MirGeneDB ID | Dan-Mir-970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-970 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-970 Aga-Mir-970 Dme-Mir-970 Dmo-Mir-970 Dsi-Mir-970 Dya-Mir-970 Gpa-Mir-970 Hme-Mir-970 Tca-Mir-970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13117: 3438256-3438320 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-970) |
Novel-14
scaffold_13117: 3425021-3425078 [+]
Ensembl
Mir-970 scaffold_13117: 3438256-3438320 [+] Ensembl |
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| Seed | CAUAAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUUAGUGGAAGAAAGGCAUUUGUUGCAGCUAGCGGGUGUUUUAUUUGGUAGCUGAUAUCGAAAGAAUCUAUCAUAAGACACACGCGGCUAUAAUCGAUGUCCUUAGAGUCUACAAGCUAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUUAGUGGAAGAAA--| U C A G UU GCUGAUAU GGCAUU GUUG AGCU GCG GUGUUUUA UGGUA C CUGUAG UAAU UCGG CGC CACAGAAU ACUAU G AAAUCGAACAUCUGAGAUUC^ C A - A -- CUAAGAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-970_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUAGCGGGUGUUUUAUUUGGUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-970_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- UCAUAAGACACACGCGGCUAU -65
Get sequence
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