Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-129-P4 | None | MIR-129 | AGCCCUU | None | None | NW_016694863.1 | 171079 | 171145 | + | Gnathostomata | Chordata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-129-P2d | None | MIR-129 | AGCCCUU | None | None | NC_030729.1 | 62832864 | 62832929 | + | X. laevis | Chordata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-129-P2c | None | MIR-129 | AGCCCUU | None | None | NC_030728.1 | 78252977 | 78253042 | - | X. laevis | Chordata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-129-P1d | None | MIR-129 | AGCCCUU | None | None | NC_030731.1 | 16187756 | 16187820 | - | X. laevis | Chordata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-129-P1c | None | MIR-129 | AGCCCUU | None | None | NC_030730.1 | 6936682 | 6936746 | + | X. laevis | Chordata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all