Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-148-P1a | xla-mir-148a | MIR-148 | CAGUGCA | MIMAT0046466 | MIMAT0046467 | NC_030734.1 | 38926039 | 38926098 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-148-P1b | None | MIR-148 | CAGUGCA | None | None | NC_030735.1 | 33079270 | 33079329 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-148-P4a | xla-mir-148b | MIR-148 | AAGUUCU | MIMAT0046468 | MIMAT0046469 | NC_030726.1 | 147746357 | 147746417 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-148-P4b | None | MIR-148 | AAGUUCU | None | None | NC_030727.1 | 128198562 | 128198622 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all