Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Ea | Em | Em | Em | Em | Em | Fe | Fe | Fe | Fe | Oo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11617-P3 | tca-mir-11617d-1 | MIR-11617 | AGUACUU | MIMAT0045598 | None | LG2 | 372276 | 372333 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11617-P4 | tca-mir-11617d-2 | MIR-11617 | AGUACUU | MIMAT0045598 | None | KQ972170 | 27517 | 27574 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11617-P5 | tca-mir-11617d-3 | MIR-11617 | AGUACUU | MIMAT0045598 | None | KQ972170 | 9816 | 9873 | - | T. castaneum | T. castaneum | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all