| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | 32 | Bl | Eg | Ga | Ov | Pl | To | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spu-Mir-10-P3 | spu-mir-125 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0009667 | MIMAT0019161 | AAGJ06000001.1 | 27044734 | 27044796 | + | Bilateria | Eumetazoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spu-Mir-10-P2n | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | AAGJ06000001.1 | 27027636 | 27027697 | + | S. purpuratus | Eumetazoa | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spu-Mir-10-P2m | spu-mir-2003 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0009744 | MIMAT0019166 | AAGJ06000001.1 | 27024190 | 27024252 | + | S. purpuratus | Eumetazoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spu-Mir-10-P1 | spu-mir-10 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0009654 | None | AAGJ06000006.1 | 38277848 | 38277918 | + | Bilateria | Eumetazoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
