Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-17-P1a | None | MIR-17 | AAAGUGC | None | None | GL849858.1 | 3487119 | 3487179 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-17-P1c | None | MIR-17 | AAAGUGC | None | None | GL867596.1 | 71642 | 71699 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-17-P4a | None | MIR-17 | AAAGUGC | None | None | GL849858.1 | 3486664 | 3486722 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-17-P4c | None | MIR-17 | AAAGUGC | None | None | GL867596.1 | 71178 | 71238 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-17-P4d | sha-mir-93 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0022819 | None | GL856864.1 | 887847 | 887908 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all