Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-19-P1g | pma-mir-19c | MIR-19 | GUGCAAA | None | MIMAT0019394 | NC_046115.1 | 750373 | 750438 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-19-P1h | pma-mir-19a | MIR-19 | GUGCAAA | None | MIMAT0019391 | NC_046132.1 | 1980048 | 1980109 | + | P. marinus | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-19-P2g | pma-mir-19b | MIR-19 | GUGCAAA | MIMAT0019392 | MIMAT0019393 | NC_046115.1 | 752202 | 752261 | + | P. marinus | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-19-P2h | None | MIR-19 | GUGCAAA | None | None | NC_046132.1 | 1985769 | 1985843 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all