| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-9-o1 | pma-mir-9a-1 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0019373 | None | NC_046108.1 | 4385189 | 4385250 | + | P. marinus | Bilateria | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-9-o2 | pma-mir-9a-2 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0019373 | MIMAT0019374 | NC_046069.1 | 28947955 | 28948015 | + | P. marinus | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-9-o3 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_046081.1 | 4287212 | 4287271 | - | P. marinus | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-9-o4 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_046120.1 | 4110016 | 4110075 | + | P. marinus | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-9-o5 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_046125.1 | 5636174 | 5636237 | + | P. marinus | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
