| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-133-o1 V | None | MIR-133 | UUGGUCC | None | None | NC_046083.1 | 5663026 | 5663083 | - | P. marinus | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-133-o2 V | None | MIR-133 | UUGGUCC | None | None | NC_046080.1 | 13840305 | 13840363 | + | P. marinus | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-133-o3 V | pma-mir-133a | MIR-133 | UUGGUCC | None | MIMAT0019460 | NC_046091.1 | 2255639 | 2255697 | + | P. marinus | Bilateria | 2 | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-133-o4 V | None | MIR-133 | UUGGUCC | None | None | NC_046111.1 | 10633037 | 10633095 | + | P. marinus | Bilateria | 2 | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
