Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-15-P1b | pbv-mir-15a | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0038829 | MIMAT0038830 | KE954284.1 | 233025 | 233084 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-15-P1c | pbv-mir-15b | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0038831 | MIMAT0038832 | KE958055.1 | 57374 | 57431 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-15-P2a | pbv-mir-16a | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0038833 | None | KE955268.1 | 105233 | 105297 | + | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-15-P2b | pbv-mir-16b | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0038834 | MIMAT0038835 | KE954284.1 | 232858 | 232921 | - | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-15-P2c | pbv-mir-16c | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0038836 | MIMAT0038837 | KE958055.1 | 56683 | 56743 | - | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all