| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | He | Ki | Te | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-199-P1 V | ocu-mir-199a-2 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0048319 | MIMAT0048320 | chr13 | 20628416 | 20628476 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-199-P2 V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | 2005146567_corrected | 71 | 131 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-199-P3 V | ocu-mir-199a-1 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0048319 | MIMAT0048320 | chrUn0216 | 201980 | 202042 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
