Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-7-P1a | gmo-mir-7a-3 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0044123 | None | GeneScaffold_4119 | 232118 | 232184 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-7-P1b | gmo-mir-7b | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0044219 | None | GeneScaffold_3319 | 52966 | 53029 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-7-P2a | gmo-mir-7a-1 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0044123 | None | GeneScaffold_1541 | 118740 | 118803 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-7-P3 | gmo-mir-7a-2 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0044123 | None | GeneScaffold_2525 | 808355 | 808415 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-7-P4a | gmo-mir-7c | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0044236 | None | GeneScaffold_3660 | 851093 | 851153 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all