| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-199-P1a V | gmo-mir-199-1 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0044025 | MIMAT0044190 | GeneScaffold_3026 | 81081 | 81141 | + | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-199-P1b V | gmo-mir-199-4 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0044025 | MIMAT0044026 | contig309706 | 96 | 156 | - | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-199-P2a V | gmo-mir-199-3 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0044025 | MIMAT0044190 | GeneScaffold_57 | 822222 | 822282 | + | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-199-P3 V | gmo-mir-199-2 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0044025 | MIMAT0044190 | GeneScaffold_2428 | 217011 | 217071 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
