| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-196-P4b | dre-mir-196c | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0011298 | None | chr11 | 2190643 | 2190701 | + | Clupeocephala | Olfactores | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-196-P4a | dre-mir-196a-1 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0001276 | None | chr23 | 36088111 | 36088169 | + | Clupeocephala | Olfactores | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-196-P3a | dre-mir-196b | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0001860 | None | chr3 | 23673387 | 23673447 | + | Clupeocephala | Olfactores | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-196-P1b | dre-mir-196d | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0011313 | None | chr16 | 20913420 | 20913478 | + | Clupeocephala | Olfactores | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-196-P1a | dre-mir-196a-2 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0001276 | MIMAT0031983 | chr19 | 19747629 | 19747686 | + | Clupeocephala | Olfactores | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
