| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-130-P1c | cpo-mir-130a | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0046980 | MIMAT0046981 | scaffold_86 | 2921906 | 2921967 | - | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-130-P2a | cpo-mir-301b | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0047144 | MIMAT0047145 | scaffold_4 | 19664333 | 19664392 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-130-P2b | cpo-mir-301a | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0047142 | MIMAT0047143 | scaffold_32 | 7094160 | 7094221 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-130-P3b | cpo-mir-454 | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0047269 | MIMAT0047270 | scaffold_32 | 7083450 | 7083514 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-130-P4a | cpo-mir-130b | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0046982 | MIMAT0046983 | scaffold_4 | 19664670 | 19664729 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
