| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Te | Te | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-338-P1 | cpi-mir-338b | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0037866 | MIMAT0037867 | JH584772 | 1374338 | 1374397 | - | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-338-P2 | cpi-mir-338a | MIR-338 | ACAAUAU | MIMAT0037864 | MIMAT0037865 | JH584464 | 13339455 | 13339515 | + | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-338-P2-as | None | MIR-338 | CAGCACC | None | None | JH584464 | 13339451 | 13339515 | - | Amniota | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
