Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Sk | Ta | Ta | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-17-P1a | aca-mir-17 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0021803 | MIMAT0021804 | GL343584.1 | 108268 | 108328 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-17-P1c | None | MIR-17 | AAAGUGC | None | None | GL344214.1 | 22328 | 22385 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-17-P4a | aca-mir-20a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0021861 | MIMAT0021862 | GL343584.1 | 108699 | 108757 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-17-P4c | aca-mir-20b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0021863 | MIMAT0021864 | GL344214.1 | 24042 | 24104 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all