Browse

81 microRNA genes with seed UACAGUA
						Sort by genome coordinates							Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Aca-Mir-101-P1-v2	aca-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0021710	MIMAT0021711	4	98411455	98411511	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Ami-Mir-101-P1-v2	ami-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038116	MIMAT0038117	NW_017710321.1	12121220	12121276	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Bta-Mir-101-P1-v2	bta-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0003520	NC_037330.1	80335450	80335506	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Cfa-Mir-101-P1-v2	cfa-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0006600	chr5	45184773	45184829	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Cli-Mir-101-P1-v2	cli-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038482	MIMAT0038483	scaffold7	15720709	15720765	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cmi-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	KI635887.1	6427948	6428004	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cpi-Mir-101-P1-v2	cpi-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0037716	MIMAT0037717	JH584706	839803	839859	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cpo-Mir-101-P1-v2	cpo-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0046947	MIMAT0046948	scaffold_2	67531173	67531229	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Dno-Mir-101-P1-v2	dno-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0047598	MIMAT0047599	JH582969	1484136	1484192	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Dre-Mir-101-P1-v2	dre-mir-101a	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0001814	chr6	31365459	31365515	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Ete-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	JH980298	60204640	60204696	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Gga-Mir-101-P1-v2	gga-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0031077	MIMAT0001185	8	28612657	28612713	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Gja-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	NW_015177048.1	96035	96091	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Gmo-Mir-101-P1-v2	gmo-mir-101a	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0044119	MIMAT0044120	GeneScaffold_1472	99850	99906	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Hsa-Mir-101-P1-v2	hsa-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0004513	MIMAT0000099	chr1	65058442	65058498	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Loc-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	LG10	10266779	10266835	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mal-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	KV884746.1	1742490	1742546	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mdo-Mir-101-P1-v2	mdo-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0031076	MIMAT0004098	2	26267876	26267932	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Mml-Mir-101-P1-v2	mml-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0026581	MIMAT0002431	chr1	64744977	64745033	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mmu-Mir-101-P1-v2	mmu-mir-101a	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0004526	MIMAT0000133	chr4	101346957	101347013	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mun-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	101-P1-v1_LR594637.1:42114281-42114423	44	100	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Oan-Mir-101-P1-v2	oan-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0007011	NC_041745.1	41083107	41083163	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Ocu-Mir-101-P1-v2	ocu-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0048186	MIMAT0048187	chr13	101340539	101340595	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Pbv-Mir-101-P1-v2	pbv-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038901	MIMAT0038902	KE954279.1	114045	114101	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Rno-Mir-101-P1-v2	rno-mir-101a	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0004726	MIMAT0000823	chr5	120168445	120168501	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Sha-Mir-101-P1-v2	sha-mir-101	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0022811	GL856736.1	1265482	1265538	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Sto-Mir-101-P1-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	BFAA01000061.1	1365252	1365308	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Tgu-Mir-101-P1-v2	tgu-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0014631	MIMAT0014508	8	1553621	1553677	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Tni-Mir-101-P1-v2	tni-mir-101a	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0002903	1	20355622	20355678	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Xtr-Mir-101-P1-v2	xtr-mir-101a-2	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0003662	chr4	79102564	79102620	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Xla-Mir-101-P1a-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	NC_030730.1	73858578	73858634	+	X. laevis	Vertebrata	No
Xla-Mir-101-P1b-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	NC_030731.1	58882294	58882350	+	X. laevis	Vertebrata	No
Aca-Mir-101-P2-v2	aca-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0021712	MIMAT0021711	2	52137658	52137714	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Ami-Mir-101-P2-v2	ami-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038118	MIMAT0038117	NW_017713772.1	32263712	32263768	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Bta-Mir-101-P2-v2	bta-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0003520	NC_037335.1	39689039	39689095	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cfa-Mir-101-P2-v2	cfa-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0006600	chr1	93194327	93194383	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Cli-Mir-101-P2-v2	cli-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038484	MIMAT0038483	scaffold6	3523035	3523091	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cmi-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	KI635975.1	375731	375786	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cpi-Mir-101-P2-v2	cpi-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0037718	MIMAT0037717	JH584680	13719007	13719063	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Cpo-Mir-101-P2-v2	cpo-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0046949	MIMAT0046948	scaffold_21	15000496	15000552	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Dno-Mir-101-P2-v2	dno-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0047600	MIMAT0047599	JH567481	2307392	2307448	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Dre-Mir-101-P2-v2	dre-mir-101b	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0001815	chr5	1837177	1837233	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Ete-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	JH980382	6713737	6713793	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Gga-Mir-101-P2-v2	gga-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0026545	MIMAT0001185	Z	27510599	27510655	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Gja-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	NW_015163623.1	608903	608959	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Gmo-Mir-101-P2-v2	gmo-mir-101b	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0044231	MIMAT0044232	GeneScaffold_3576	29660	29716	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Hsa-Mir-101-P2-v2	hsa-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0037312	MIMAT0000099	chr9	4850309	4850365	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Loc-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	LG2	37364266	37364322	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mal-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	KV884763.1	1469812	1469868	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Mdo-Mir-101-P2-v2	mdo-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0026657	MIMAT0004098	6	166669178	166669234	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Mml-Mir-101-P2-v2	mml-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0031100	MIMAT0002431	chr15	79649348	79649404	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mmu-Mir-101-P2-v2	mmu-mir-101b	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0017046	MIMAT0000616	chr19	29135303	29135359	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Mun-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	101-P2-v1_LR594633.1:234314504-234314646	44	100	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Oan-Mir-101-P2-v2	oan-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0007011	NC_041753.1	52495167	52495223	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Ocu-Mir-101-P2-v2	ocu-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0048188	MIMAT0048187	chr1	49384672	49384728	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Pbv-Mir-101-P2-v2	pbv-mir-101-2	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0038903	MIMAT0038902	KE954797.1	126582	126638	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Rno-Mir-101-P2-v2	rno-mir-101b	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0017045	MIMAT0000615	chr1	247263747	247263803	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Sha-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	GL841562.1	1424391	1424447	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Sto-Mir-101-P2-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	BFAA01004869.1	93867	93923	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Tgu-Mir-101-P2-v2	tgu-mir-101-1	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0031101	MIMAT0014508	Z	68899073	68899129	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Tni-Mir-101-P2-v2	tni-mir-101b	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0003040	4	1028861	1028917	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Xtr-Mir-101-P2-v2	xtr-mir-101a-1	MIR-101	UACAGUA	None	MIMAT0003662	chr1	115031352	115031408	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Xla-Mir-101-P2a-v2	xla-mir-101	MIR-101	UACAGUA	MIMAT0046412	MIMAT0046413	NC_030724.1	125355860	125355916	-	X. laevis	Vertebrata	No
Xla-Mir-101-P2b-v2	None	MIR-101	UACAGUA	None	None	NW_016694889.1	314987	315043	-	X. laevis	Vertebrata	No		1
Ete-Mir-144	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	JH980319	4842438	4842495	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Lch-Mir-144	None	MIR-144	UACAGUA	None	None	JH127350.1	728206	728264	-	Vertebrata	Vertebrata	Unknown
Pbv-Mir-144	pbv-mir-144	MIR-144	UACAGUA	MIMAT0038957	MIMAT0038958	KE957536.1	98855	98911	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1		1
Spt-Mir-144	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	QEPC01008384.1	2358679	2358736	+	Vertebrata	Vertebrata	Unknown			1
Aca-Mir-144-v2	aca-mir-144	MIR-144	GAUAUCA	MIMAT0021771	MIMAT0021772	G889P68288RO14	342	398	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Cli-Mir-144-v2	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	SRR516967	48	105	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Dre-Mir-144-v2	dre-mir-144	MIR-144	UACAGUA	MIMAT0031975	MIMAT0001841	chr5	42272092	42272150	-	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Ebu-Mir-144-v2	None	MIR-144	UACAGUA	None	None	FYBX02009908.1	8547203	8547259	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Gja-Mir-144-v2	None	MIR-144	UACAGUA	None	None	NW_015173122.1	2276609	2276665	-	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Gmo-Mir-144-v2	gmo-mir-144	MIR-144	UACAGUA	MIMAT0044027	MIMAT0044028	contig314418	343	401	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Hsa-Mir-144-v2	hsa-mir-144	MIR-144	UACAGUA	MIMAT0004600	MIMAT0000436	chr17	28861547	28861604	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Loc-Mir-144-v2	None	MIR-144	UACAGUA	None	None	LG22	3766309	3766367	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Mal-Mir-144-v2	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	KV884735.1	275834	275892	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Mun-Mir-144-v2	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	144-v1_LR594644.1:58948985-58949242	101	158	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Tgu-Mir-144-v2	tgu-mir-144	MIR-144	GAUAUCA	MIMAT0014650	MIMAT0014596	19	4217046	4217103	+	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Xla-Mir-144-P1-v1	None	MIR-144	GAUAUCA	None	None	NC_030726.1	32856364	32856421	+	X. laevis	Vertebrata	No	1		1
Xla-Mir-144-P2-v1	xla-mir-144	MIR-144	GAUAUCA	MIMAT0046458	MIMAT0046459	NC_030727.1	4344085	4344142	-	X. laevis	Vertebrata	No	1		1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all