MirGeneDB

170 microRNA genes with node of origin E. fetida
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Efe-Bantam-P6 None BANTAM GAGAUCA None None Efet.01.59348 454 515 + E. fetida Protostomia No
Efe-Bantam-P7 None BANTAM GAGAUCA None None Efet.01.127987 1361 1420 - E. fetida Protostomia No
Efe-Bantam-P8 None BANTAM GAGAUCA None None Efet.01.377353 2266 2325 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Let-7-P10 None LET-7 GAGGUAG None None Efet.01.122508 4741 4806 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Let-7-P11 None LET-7 GAGGUAG None None Efet.01.45480 2322 2390 - E. fetida Bilateria No
Efe-Let-7-P12 None LET-7 GAGGUAG None None Efet.01.442344 153 221 - E. fetida Bilateria Unknown
Efe-Let-7-P13 None LET-7 GAGGUAG None None Efet.01.371127 1161 1231 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Let-7-P14 None LET-7 GAGGUAG None None Efet.01.6843 1957 2025 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-1-P5 None MIR-1 GGAAUGU None None Efet.01.1616378 99 157 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-1-P6 None MIR-1 GGAAUGU None None Efet.01.369952 2969 3031 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-1-P7 None MIR-1 GGAAUGU None None Efet.01.296011 338 398 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-1-P8 None MIR-1 GGAAUGU None None Efet.01.624356 499 560 - E. fetida Bilateria Yes 1 1
Efe-Mir-2-o44 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.126385 2777 2840 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-2-o45 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.128711 2118 2173 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o46 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.155957 2068 2132 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o47 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.155957 5781 5841 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o48 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.1558418 151 207 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-2-o49 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.159362 1072 1126 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o50 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.159362 648 708 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-7-P7 None MIR-7 GGAAGAC None None scaffold21967-size3459 841 901 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-7-P8 None MIR-7 GGAAGAC None None Efet.01.613966 1312 1375 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-7-P9 None MIR-7 GGAAGAC None None Efet.01.297570 2753 2810 - E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-8-P4 None MIR-8 AAUACUG None None Efet.01.118063 3502 3564 - E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-8-P5 None MIR-8 AAUACUG None None Efet.01.600573 521 584 - E. fetida Bilateria No 1 1 1
Efe-Mir-8-P6 None MIR-8 AAUACUG None None Efet.01.50405 2469 2536 + E. fetida Bilateria Yes 1 1
Efe-Mir-9-P15 None MIR-9 CUUUGGU None None Efet.01.650086 1540 1600 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-9-P16 None MIR-9 CUUUGGU None None Efet.01.1380669 63 123 - E. fetida Bilateria Unknown 1
Efe-Mir-10-P1e None MIR-10 ACCCUGU None None Efet.01.83868 1034 1091 - E. fetida Eumetazoa Yes 1
Efe-Mir-10-P1f None MIR-10 ACCCUGU None None Efe-Mir-10-P1f_manual_assembly 44 104 + E. fetida Eumetazoa No 1
Efe-Mir-10-P2g None MIR-10 ACCCGUA None None Efet.01.1260463 37 96 - E. fetida Eumetazoa No 1
Efe-Mir-10-P2h None MIR-10 ACCCGUA None None Efet.01.217092 3740 3802 - E. fetida Eumetazoa No 1
Efe-Mir-10-P2i None MIR-10 ACCCGUA None None Efet.01.356293 985 1043 - E. fetida Eumetazoa No
Efe-Mir-10-P2j None MIR-10 ACCCGUA None None Efet.01.424946 1302 1367 - E. fetida Eumetazoa No
Efe-Mir-10-P2k None MIR-10 ACCCGUA None None Efet.01.530201 300 362 - E. fetida Eumetazoa Yes 1 1
Efe-Mir-10-P3g None MIR-10 CCCUGAG None None Efet.01.31863 2338 2394 - E. fetida Eumetazoa No 1 1
Efe-Mir-10-P3h None MIR-10 CCCUGAG None None Efet.01.1611524 167 224 + E. fetida Eumetazoa No
Efe-Mir-10-P3i None MIR-10 CCCUGAG None None Efet.01.164893 967 1031 + E. fetida Eumetazoa No 1
Efe-Mir-10-P4a None MIR-10 GAAGCUC None None Efet.01.2093 2861 2927 - E. fetida Eumetazoa No 1
Efe-Mir-10-P4b None MIR-10 GAAGCUC None None Efet.01.39653 2193 2256 + E. fetida Eumetazoa No 1 1
Efe-Mir-10-P4c None MIR-10 GAAGCUC None None Efet.01.438967 284 359 - E. fetida Eumetazoa No 1 1
Efe-Mir-10-P5a None MIR-10 UACCCUG None None Efet.01.220021 970 1033 + E. fetida Eumetazoa No
Efe-Mir-10-P5b None MIR-10 UACCCUG None None Efet.01.592112 1135 1197 + E. fetida Eumetazoa No
Efe-Mir-12-P1 None MIR-12 GAGUAUU None None Efet.01.276528 2647 2707 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-12-P2 None MIR-12 GAGUAUU None None scaffold9233-size18363 16287 16347 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-22-P1c None MIR-22 GCUGCCU None None Efet.01.45172 3574 3634 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-22-P1d None MIR-22 GCUGCCU None None Efe-Mir-22-P1d_manual_assembly 47 107 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-29-P1e None MIR-29 AGCACCA None None Efet.01.104156 707 765 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-29-P1f None MIR-29 AGCACCA None None Efet.01.95745 2230 2289 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-29-P2c None MIR-29 AGCACCA None None Efet.01.160771 646 704 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-29-P2d None MIR-29 AGCACCA None None Efet.01.454037 307 366 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-36-P9 None MIR-36 CACCGGG None None Efet.01.42296 4397 4458 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-36-P10 None MIR-36 CACCGGG None None Efet.01.229867 2803 2864 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-67-P1 None MIR-67 CACAACC None None Efet.01.111281 4953 5013 + E. fetida Protostomia No 1 1
Efe-Mir-67-P2 None MIR-67 CCUUAUU None None Efet.01.29421 209 271 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-67-P3 None MIR-67 CACAACC None None Efet.01.73720 826 889 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-71-P1 None MIR-71 GAAAGAC None None Efet.01.155957 625 687 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-71-P2 None MIR-71 GAAAGAC None None Efet.01.1057065 32 94 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-71-P3 None MIR-71 GAAAGAC None None Efet.01.126385 1893 1951 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-87-o11 None MIR-87 CGCCUGA None None Efet.01.588090 349 410 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-87-o12 None MIR-87 UGAGCAA None None Efet.01.236014 861 925 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-87-o13 None MIR-87 UGAGCAA None None scaffold4028-size35901 11038 11096 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-87-o14 None MIR-87 UGAGCAA None None Efet.01.53011 1093 1153 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-87-o15 None MIR-87 UGAGCAA None None Efet.01.241300 131 190 - E. fetida Protostomia No 1 1 1
Efe-Mir-87-o16 None MIR-87 UGAGCAA None None Efet.01.244941 2060 2124 + E. fetida Protostomia No 1 1
Efe-Mir-87-o17 None MIR-87 UGAGCAA None None Efet.01.649873 298 359 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-92-o38 None MIR-92 AUUGCAC None None Efet.01.162814 4080 4143 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-92-o39 None MIR-92 AUUGCAC None None Efet.01.539975 113 174 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-96-P2d None MIR-96 UUGGCAC None None Efet.01.342161 1259 1320 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-96-P2e None MIR-96 UUGGCAC None None Efet.01.217172 1570 1639 + E. fetida Bilateria Unknown 1
Efe-Mir-124-P5 None MIR-124 AAGGCAC None None Efet.01.191600 2530 2596 + E. fetida Bilateria No 1 1 1
Efe-Mir-124-P6 None MIR-124 AAGGCAC None None Efet.01.61867 2146 2211 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-124-P7 None MIR-124 AAGGCAC None None Efet.01.199219 474 539 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-124-P8 None MIR-124 AAGGCAC None None Efet.01.599499 601 662 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-124-P9 None MIR-124 AAGGCAC None None Efet.01.62080 4979 5039 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-137-P4 None MIR-137 UAUUGCU None None Efet.01.48293 1456 1515 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-137-P5 None MIR-137 AUUGCUU None None scaffold2541-size46483 10866 10927 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-137-P6 None MIR-137 AUUGCUU None None Efet.01.140209 563 625 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-137-P7 None MIR-137 UAUUGCU None None Efet.01.385798 4320 4378 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-137-P8 None MIR-137 UAUUGCU None None Efet.01.590987 869 928 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-137-P9 None MIR-137 AUUGCUU None None Efet.01.626403 916 977 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-137-P10 None MIR-137 AUUGCUU None None Efet.01.60994 4905 4965 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-153-P5 None MIR-153 UGCAUAG None None Efet.01.60561 1490 1548 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-153-P6 None MIR-153 UGCAUAG None None Efet.01.33572 2693 2749 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-184-o1 None MIR-184 GGACGGA None None Efet.01.513765 425 483 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-184-o2 None MIR-184 GGACGGA None None Efet.01.63752 518 578 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-184-o3 None MIR-184 GGACGGA None None Efet.01.634299 361 419 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-184-o4 None MIR-184 GGACGGA None None Efet.01.151028 3429 3487 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-190-P3 None MIR-190 GAUAUGU None None Efet.01.392904 384 443 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-190-P4 None MIR-190 GAUAUGU None None Efet.01.642144 166 228 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-190-P5 None MIR-190 GAUAUGU None None Efet.01.129016 2219 2283 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-190-P6 None MIR-190 GAUAUGU None None Efet.01.318588 3126 3186 + E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-193-P1g None MIR-193 ACUGGCC None None Efet.01.601053 958 1017 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-193-P1h None MIR-193 ACUGGCC None None Efet.01.135638 1821 1882 - E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-193-P2c-v1 None MIR-193 AAUGCCC None None Efet.01.30034 1214 1278 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-193-P2c-v2 None MIR-193 UAAUGCC None None Efet.01.30034 1214 1278 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-193-P2d-v1 None MIR-193 AAUGCCC None None Efet.01.423007 841 901 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-193-P2d-v2 None MIR-193 UAAUGCC None None Efet.01.423007 841 901 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-193-P2e-v1 None MIR-193 AAUGCCC None None Efet.01.517063 880 942 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-193-P2e-v2 None MIR-193 UAAUGCC None None Efet.01.517063 880 942 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-193-P2f-v1 None MIR-193 AAUGCCC None None Efet.01.1370857 57 119 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-193-P2f-v2 None MIR-193 AUGCCCU None None Efet.01.1370857 57 119 + E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-216-P2a None MIR-216 AAUAUCA None None Efet.01.10466 6597 6657 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-216-P2b None MIR-216 AAUAUCA None None Efet.01.65362 517 605 - E. fetida Bilateria No 1 1
Efe-Mir-219-P3 None MIR-219 GAUUGUC None None Efet.01.125734 1344 1402 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-219-P4 None MIR-219 GAUUGUC None None Efet.01.135199 2555 2617 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-219-P5 None MIR-219 GAUUGUC None None Efet.01.56519 3866 3931 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-278-P1-v1 None MIR-278 CGGUGGG None None Efet.01.1652561 479 543 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-278-P1-v2 None MIR-278 UCGGUGG None None Efet.01.1652561 479 543 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-278-P2 None MIR-278 CGGUGGG None None Efet.01.249401 3113 3172 + E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-279-o14 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.179746 5176 5236 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-279-o15 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.199475 1965 2030 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-279-o16 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.229038 770 830 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-279-o17 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.77336 1798 1860 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-279-o18 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.1630742 220 281 - E. fetida Protostomia No 1 1
Efe-Mir-279-o19 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.388011 41 103 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-279-o20 None MIR-279 GACUAGA None None Efet.01.1381559 71 129 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-281-P5 None MIR-281 GUCAUGG None None Efet.01.315753 639 701 - E. fetida Bilateria No
Efe-Mir-281-P6 None MIR-281 GUCAUGG None None Efet.01.144640 833 891 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-281-P7 None MIR-281 AGGGAGC None None Efet.01.597003 1587 1645 - E. fetida Bilateria No 1
Efe-Mir-317-P5 None MIR-317 GAACACA None None Efet.01.557472 631 689 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-317-P6 None MIR-317 GAACACA None None Efet.01.212478 2808 2870 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-317-P7 None MIR-317 GAACACA None None Efet.01.130990 1760 1827 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-750-P1 None MIR-750 CAGAUCU None None Efet.01.20002 2998 3060 + E. fetida Protostomia No 1 1
Efe-Mir-750-P2 None MIR-750 CAGAUCU None None Efet.01.25323 4651 4715 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-750-P3 None MIR-750 CAGAUCU None None Efet.01.1571559 54 114 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-1175-P1 None MIR-1175 GAGAUUC None None Efet.01.20002 3803 3861 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-1175-P2 None MIR-1175 GAGAUUC None None Efet.01.575070 94 156 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-1990-P3 None MIR-1990 CGGGACU None None Efet.01.219023 2496 2554 + E. fetida Lophotrochozoa No 1
Efe-Mir-1992-P3 None MIR-1992 CAGCAGU None None Efet.01.192781 1365 1426 - E. fetida Lophotrochozoa No 1
Efe-Mir-1992-P4 None MIR-1992 CAGCAGU None None Efe-Mir-1992-P4_manual_assembly 60 121 + E. fetida Lophotrochozoa Yes 1
Efe-Mir-1993-P1 None MIR-1993 AUUAUGC None None Efet.01.1536008 48 133 - E. fetida Protostomia No 1 1
Efe-Mir-1993-P2 None MIR-1993 CGGAAAU None None Efet.01.1652592 367 429 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-1995-P1 None MIR-1995 UACAUCU None None Efet.01.89326 472 531 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-1995-P2 None MIR-1995 UACAUCU None None Efet.01.516694 2949 3007 + E. fetida Annelida No 1 1
Efe-Mir-1996-P1 None MIR-1996 UCAAGUG None None Efet.01.625385 844 904 + E. fetida Annelida No 1 1
Efe-Mir-1996-P2 None MIR-1996 UCAAGUG None None Efet.01.40739 1521 1580 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-1996-P3 None MIR-1996 UCAAGUG None None Efet.01.53477 425 491 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-1997-P1 None MIR-1997 CUGCAGG None None Efet.01.511825 1660 1722 + E. fetida Annelida No
Efe-Mir-1997-P2 None MIR-1997 CUGCAGG None None Efet.01.386486 2534 2595 + E. fetida Annelida No
Efe-Mir-1997-P3 None MIR-1997 CUGCAGG None None Efet.01.3296 9001 9065 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-1997-P4 None MIR-1997 GGCUGAU None None scaffold10491-size15725 1260 1321 - E. fetida Annelida No 1 1
Efe-Mir-1997-P5 None MIR-1997 CUGCAGG None None Efet.01.1572519 86 149 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-1998-P1 None MIR-1998 UGAACGC None None Efet.01.35851 446 506 - E. fetida Annelida No
Efe-Mir-1998-P2 None MIR-1998 UGAACGC None None Efet.01.58205 4197 4257 - E. fetida Annelida No
Efe-Mir-2000-P1 None MIR-2000 AAGUCUU None None Efet.01.58205 3094 3153 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2000-P2 None MIR-2000 AAGUCUU None None Efet.01.1442459 57 114 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2685-P2a None MIR-2685 AACUCAG None None Efet.01.107287 3378 3440 + E. fetida Annelida No
Efe-Mir-2685-P2b None MIR-2685 AACUCAG None None Efe-Mir-2685-P2b_manual_assembly 37 98 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2686-o1 None MIR-2686 AGAUGUU None None Efet.01.385486 2629 2688 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2686-o2 None MIR-2686 AGAUGUU None None Efet.01.406684 3353 3416 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2686-o3 None MIR-2686 AGAUGUU None None Efet.01.173894 327 394 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2689-P1 None MIR-2689 AUCCUGG None None Efet.01.256098 288 351 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2689-P2 None MIR-2689 AUCCUGG None None Efet.01.57033 882 945 + E. fetida Annelida Yes 1
Efe-Mir-2690-P1 None MIR-2690 GUGAAAG None None Efet.01.550544 395 458 - E. fetida Annelida No 1 1
Efe-Mir-2690-P2 None MIR-2690 GUGAAAG None None Efet.01.54429 6414 6475 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2690-P3 None MIR-2690 GUGAAAG None None Efet.01.1606222 228 288 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2690-P4 None MIR-2690 GUGAAAG None None Efet.01.1631089 223 286 + E. fetida Annelida No 1 1
Efe-Mir-2691-P1 None MIR-2691 UUUGCAA None None Efet.01.521505 1585 1650 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2691-P2 None MIR-2691 UUUGCAA None None Efet.01.1650192 337 401 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2691-P3 None MIR-2691 UUUGCAA None None Efet.01.299984 674 735 - E. fetida Annelida No
Efe-Mir-2691-P4 None MIR-2691 UUUGCAA None None Efet.01.144187 350 425 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2693-P1 None MIR-2693 GAAAUUG None None Efet.01.245815 1515 1575 + E. fetida Annelida No 1
Efe-Mir-2693-P2 None MIR-2693 GAAAUUG None None Efet.01.511636 2808 2868 - E. fetida Annelida No 1
Efe-Novel-1 None EFE-NOVEL-1 AAUUGUG None None Efet.01.153161 835 895 + E. fetida E. fetida No 1 1
Efe-Novel-2 None EFE-NOVEL-2 GUGACGA None None Efet.01.119533 6636 6699 + E. fetida E. fetida No 1
Efe-Novel-3-P1 None EFE-NOVEL-3 GUAGCCA None None Efet.01.157941 683 742 + E. fetida E. fetida No 1 1
Efe-Novel-3-P2 None EFE-NOVEL-3 GUAGCCA None None Efet.01.369807 44 115 - E. fetida E. fetida Yes 1
Efe-Novel-4 None EFE-NOVEL-4 GAGGAGG None None Efet.01.657955 785 845 - E. fetida E. fetida No
Efe-Novel-5 None EFE-NOVEL-5 AAAAGGU None None Efet.01.64621 3288 3349 - E. fetida E. fetida No
Efe-Novel-6 None EFE-NOVEL-6 AUGUGAC None None Efet.01.141380 5618 5675 - E. fetida E. fetida No 1

Get sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all