MirGeneDB 3.0

62 microRNA genes of family MIR-1421
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Oan-Mir-1421-P54 None MIR-1421 GGAGGUC None None NC_041749.1 96830817 96830877 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P53 None MIR-1421 CGCAUGG None None NC_041749.1 96828984 96829044 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P52b None MIR-1421 GGAGGCC None None NC_041749.1 96827002 96827062 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P52a oan-mir-1421an MIR-1421 GGAGGCC MIMAT0028972 MIMAT0028973 NC_041749.1 96833979 96834039 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P51 oan-mir-1421a MIR-1421 AGGUUAC MIMAT0006963 MIMAT0006964 NC_041749.1 96826285 96826341 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P50 oan-mir-1421b MIR-1421 CGAGGUC MIMAT0006965 MIMAT0006966 NC_041749.1 96824715 96824775 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P49 oan-mir-1421c MIR-1421 AGGUUAC MIMAT0006967 MIMAT0006968 NC_041749.1 96823569 96823625 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P48 oan-mir-1421d MIR-1421 GGAAGUC MIMAT0006969 MIMAT0006970 NC_041749.1 96822927 96822987 + O. anatinus O. anatinus No 1 1 1
Oan-Mir-1421-P47 oan-mir-1421e MIR-1421 GCGUGGA MIMAT0006971 MIMAT0006972 NC_041749.1 96822447 96822507 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P46 oan-mir-1421f MIR-1421 GGAAGUU MIMAT0006973 MIMAT0006974 NC_041749.1 96821372 96821432 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P45 oan-mir-1421g-1 MIR-1421 GGGGGUC MIMAT0006975 MIMAT0006976 NC_041749.1 96820252 96820312 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P44 oan-mir-1421h MIR-1421 GGUCACC MIMAT0006977 MIMAT0006978 NC_041749.1 96819518 96819575 + O. anatinus O. anatinus No 1 1 1
Oan-Mir-1421-P43 oan-mir-1421j MIR-1421 AGUCACG MIMAT0006981 MIMAT0026757 NC_041749.1 96816733 96816787 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P42 oan-mir-1421k-1 MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007066 MIMAT0007067 NC_041749.1 96812547 96812607 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P41 oan-mir-1421l-1 MIR-1421 AGUGGUC MIMAT0007068 MIMAT0007069 NC_041749.1 96811675 96811735 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P40 oan-mir-1421g-2 MIR-1421 GGGGGUC MIMAT0006975 MIMAT0009176 NC_041749.1 96810304 96810363 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P39 oan-mir-1421m MIR-1421 GGACGUC MIMAT0007072 MIMAT0007073 NC_041749.1 96808270 96808331 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P38 oan-mir-1421n-1 MIR-1421 GGUGGUC MIMAT0007074 MIMAT0007075 NC_041749.1 96806411 96806471 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P37 oan-mir-1421l-2 MIR-1421 AGUGGUC MIMAT0007068 MIMAT0009181 NC_041749.1 96805105 96805165 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P36b oan-mir-1421k-3 MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007066 MIMAT0009179 NC_041749.1 96804289 96804349 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P36a oan-mir-1421k-2 MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007066 MIMAT0009179 NC_041749.1 96810861 96810921 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P35 oan-mir-1421g-3 MIR-1421 GGGGGUC MIMAT0006975 None NC_041749.1 96803731 96803791 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P34 oan-mir-1421o MIR-1421 GGUCACA MIMAT0007076 MIMAT0007077 NC_041749.1 96803000 96803054 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P33 oan-mir-1421q MIR-1421 GGUGGUC MIMAT0007080 MIMAT0007081 NC_041749.1 96800689 96800749 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P32 oan-mir-1421r MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007082 MIMAT0007083 NC_041749.1 96799874 96799934 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P31c oan-mir-1421i-1 MIR-1421 GGAGGCC MIMAT0006979 MIMAT0006980 NC_041749.1 96816957 96817017 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1
Oan-Mir-1421-P31b oan-mir-1421i-3 MIR-1421 GGAGGCC MIMAT0006979 MIMAT0009178 NC_041749.1 96799320 96799380 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P31a oan-mir-1421i-2 MIR-1421 GGAGGCC MIMAT0006979 MIMAT0009177 NC_041749.1 96802450 96802510 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P30 oan-mir-1421ak MIR-1421 CUGCAUA MIMAT0007309 MIMAT0007310 NC_041749.1 96798506 96798563 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P29b oan-mir-1421p-1 MIR-1421 GGGGGCC MIMAT0007078 MIMAT0007079 NC_041749.1 96801390 96801450 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P29a oan-mir-1421p-2 MIR-1421 GGGGGCC MIMAT0007078 MIMAT0007079 NC_041749.1 96797344 96797411 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P28 oan-mir-1421s MIR-1421 GGUGGUC MIMAT0007084 MIMAT0007085 NC_041749.1 96796646 96796706 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P27 oan-mir-1421t MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007086 MIMAT0007087 NC_041749.1 96795832 96795892 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1 1
Oan-Mir-1421-P26 None MIR-1421 GGAGGUC None None NC_041749.1 96795273 96795333 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P25 oan-mir-1421n-2 MIR-1421 GGUGGUC MIMAT0007074 MIMAT0009168 NC_041749.1 96794548 96794608 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P24 oan-mir-1421u MIR-1421 GGUGGCC MIMAT0007088 None NC_041749.1 96791800 96791860 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P23 oan-mir-1421al MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007311 MIMAT0007312 NC_041749.1 96791221 96791281 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P22 oan-mir-1421am MIR-1421 GGAGGUC MIMAT0007313 None NC_041749.1 96790662 96790722 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1 1
Oan-Mir-1421-P21 oan-mir-1421v MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007236 MIMAT0007237 NC_041749.1 96875181 96875241 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1 1
Oan-Mir-1421-P20 None MIR-1421 GCAGGUC None None NC_041749.1 96831372 96831433 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P19 oan-mir-1421x MIR-1421 GUAGGUC MIMAT0007242 MIMAT0007243 NC_041749.1 96873176 96873236 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P18 oan-mir-1421y-1 MIR-1421 GGAGGGC MIMAT0007244 None NC_041749.1 96872639 96872699 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1
Oan-Mir-1421-P17 oan-mir-1421z MIR-1421 GCAGGUC MIMAT0007245 MIMAT0007246 NC_041749.1 96868684 96868744 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P16 oan-mir-1421aa MIR-1421 ACAGGUC MIMAT0007249 MIMAT0007250 NC_041749.1 96866978 96867038 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P15 oan-mir-1421y-2 MIR-1421 GGAGGGC MIMAT0007244 MIMAT0009172 NC_041749.1 96863738 96863798 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P14 None MIR-1421 GGAGGUC None None NC_041749.1 96862608 96862668 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1
Oan-Mir-1421-P13b oan-mir-1421ab-2 MIR-1421 GGAGCUC MIMAT0007251 MIMAT0007300 NC_041749.1 96864853 96864913 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P13a oan-mir-1421ab-1 MIR-1421 GGAGCUC MIMAT0007251 MIMAT0007252 NC_041749.1 96860142 96860202 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P12 oan-mir-1421ai MIR-1421 GCAGGUC MIMAT0007305 MIMAT0007306 NC_041749.1 96857179 96857236 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P11 None MIR-1421 ACAGGUU None None NC_041749.1 96856623 96856683 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P10 oan-mir-1421y-3 MIR-1421 GGAGGGC MIMAT0007244 MIMAT0009173 NC_041749.1 96855616 96855676 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P9 oan-mir-1421ac-2 MIR-1421 GGAGGAC MIMAT0007257 MIMAT0007302 NC_041749.1 96850234 96850294 + O. anatinus O. anatinus No 1
Oan-Mir-1421-P8 oan-mir-1421ac-1 MIR-1421 GGAGGAC MIMAT0007257 MIMAT0007258 NC_041749.1 96847806 96847866 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P7c oan-mir-1421ag-1 MIR-1421 UUGAGGU MIMAT0007297 MIMAT0007298 NC_041749.1 96863179 96863242 + O. anatinus O. anatinus Unknown
Oan-Mir-1421-P7b oan-mir-1421ag-2 MIR-1421 GAGUUGG None MIMAT0007298 NC_041749.1 96855059 96855119 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1 1
Oan-Mir-1421-P7a None MIR-1421 GAGGUGG None None NC_041749.1 96847250 96847310 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1 1
Oan-Mir-1421-P6 oan-mir-1421aj MIR-1421 GGAGGAC MIMAT0007307 MIMAT0007308 NC_041749.1 96844751 96844811 + O. anatinus O. anatinus No
Oan-Mir-1421-P5 oan-mir-1421ad MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007259 MIMAT0007260 NC_041749.1 96844194 96844254 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P4 oan-mir-1421ae MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007261 None NC_041749.1 96842948 96843008 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P3 None MIR-1421 GGAGGAC None None NC_041749.1 96840770 96840830 + O. anatinus O. anatinus Unknown 1
Oan-Mir-1421-P2 oan-mir-1421af MIR-1421 ACAGGUU MIMAT0007264 MIMAT0007265 NC_041749.1 96840218 96840278 + O. anatinus O. anatinus No 1 1
Oan-Mir-1421-P1 oan-mir-1421ah MIR-1421 GGAGGAC MIMAT0007303 MIMAT0007304 NC_041749.1 96837949 96838010 + O. anatinus O. anatinus No 1 1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all