MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-514b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cpo-Mir-506-o8 Hsa-Mir-506-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 140957066-140957123 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P8) |
Mir-506-P6b1
chrX: 140909251-140909308 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6c1 chrX: 140924370-140924427 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a chrX: 140933343-140933400 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 140947157-140947214 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 140953023-140953080 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P8 chrX: 140957066-140957123 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4e chrX: 140966427-140966484 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5 chrX: 140974554-140974611 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7a chrX: 140981185-140981242 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUUAAAUGUUCUAUUCCUCAUGUGGUACUCUUCUCAAGAGGGAGGCAAUCAUGUGUAAUUAGAUAUGAUUGACACCUCUGUGAGUAGAGUAACACAUGGUAUUUCCAUCAUCUGACAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUUAAAUGUUCUAUUCC-- G U -| GAGG GUGUA UCAUGUG UACUCU CUCA AGAGG CAAUCAU A GGUACAC AUGAGA GAGU UCUCC GUUAGUA U UACAGUCUACUACCUUUAU A U G^ ACA- UAGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-506-P8_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0027119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCUCAAGAGGGAGGCAAUCAU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-514b-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P8_3p |
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mirBase accession | MIMAT0024348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUUGACACCUCUGUGAGUAGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-514b-3p |