MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAAGGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P1 Cfa-Mir-506-P1 Cpo-Mir-506-o1 Cpo-Mir-506-P1 Dno-Mir-506-P1 Hsa-Mir-506-P1 Mmu-Mir-506-P1 Ocu-Mir-506-P1 Rno-Mir-506-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P1) |
Mir-506-P6b2
chrX: 140902118-140902175 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6b1 chrX: 140909251-140909308 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6c1 chrX: 140924370-140924427 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a chrX: 140933343-140933400 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 140947157-140947214 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 140953023-140953080 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P8 chrX: 140957066-140957123 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4e chrX: 140966427-140966484 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5 chrX: 140974554-140974611 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7a chrX: 140981185-140981242 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGUGUCUAGUGCCGUUAUGUGUAGUGCCUUAUUCAGGAAGGUGUUACUUAAUAUAUUAAUAUUUGUAAGGCACCCUUCUGAGUAGAGUAAUGUGCAACAUGGACAUCAUUUGUGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUGUGUCUAGUGCCGUUA-- UG G C A --| UUAAUAUA UG UA UGC UUAUUCAGGA GGUGU UAC \ AC GU AUG GAUGAGUCUU CCACG AUG U UGGUGUUUACUACAGGUACA GU A A C GA^ UUUAUAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mml-Mir-506-P1_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0026745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUUCAGGAAGGUGUUACUUAAU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-506-5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mml-Mir-506-P1_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0005762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- GUAAGGCACCCUUCUGAGUAGA -57
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-506-3p |