MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUGUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-892c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-506-P13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 139700246-139700302 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P13) |
Mir-506-P13
chrX: 139700246-139700302 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P10 chrX: 139701739-139701795 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P9 chrX: 139702265-139702321 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P11 chrX: 139703819-139703875 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P12 chrX: 139704349-139704405 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAAUCAGUCGUGCUGUGGGCAGUGCUCUAUUCAGAAAGGUGCCAGUCACUUAGAUUACAUGUCACUGUUUCCUUUCUGAGUGGAGUAAGGCUUACCAAGUACAAGUGUGUGGUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAAUCAGUCGUGCU--| AG UGC C UUAGA GUGGGC UGCUCUAUUCAGAAAGG CAGU AC \ CAUUCG AUGAGGUGAGUCUUUCC GUCA UG U GUGGUGUGUGAACAUGAAC^ GA UUU C UACAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-506-P13_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0028384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUUCAGAAAGGUGCCAGUCAC -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-892c-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P13_3p |
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mirBase accession | MIMAT0028385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CACUGUUUCCUUUCUGAGUGGA -57
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-892c-3p |