| MirGeneDB ID | Tgu-Mir-2131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2131 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | tgu-mir-2131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cli-Mir-2131 Gga-Mir-2131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neognathae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neognathae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (TaeGut1_add) |
Z: 39830270-39830334 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2131) |
Mir-2954
Z: 39812452-39812511 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-2131 Z: 39830270-39830334 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGCAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUUCUGUUAAAGAAUGCUCUUGUGGCUUCCAUGCAGAAGUGCACAGAAACAGCUAUUUGCAAUUAAGAAGUUGGCUGUUACUGUUUUUCUGAUGGAUGCUGUUGGAUUAUGACACUGACAUGGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUUCUGUUAAAGAAUGC--| U UG U G UGC A AUUUGCAA UCU G GC UCCAU CAGAAG ACAG AACAGCU U AGG U CG AGGUA GUCUUU UGUC UUGUCGG U ACGGUACAGUCACAGUAUU^ U GU U - U-- A UUGAAGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Tgu-Mir-2131_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0025410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUGCAGAAGUGCACAGAAACAGCU -24
Get sequence
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| Co-mature sequence | Tgu-Mir-2131_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- CUGUUACUGUUUUUCUGAUGG -65
Get sequence
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