MirGeneDB ID | Pca-Mir-29-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-29 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Pca-Mir-29-o7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Gsp-Mir-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ717034.1: 31025-31084 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUCACCUACGAUUCUAGGCACCGCUGAGGCCUGGUAUCAAAUGGUGGAUAGAUGCUCACAAAUGUUCUAGCACCAUUUGAAAUCAGUGCCGCCGCGGUCGCCAUGGCAACAGUGAUGACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUUCACCUACGAUUCUAG - UGA -| A GA UGCUCA GC ACCGC GGC CUGGU UCAAAUGGUG UAGA \ CG UGGCG CCG GACUA AGUUUACCAC AUCU C CAGUAGUGACAACGGUAC C CCG U^ A G- UGUAAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pca-Mir-29-o6_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUGGUAUCAAAUGGUGGAUAGA -23
Get sequence
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Mature sequence | Pca-Mir-29-o6_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGC -60
Get sequence
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