| MirGeneDB ID | Pab-Mir-616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-616 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-616 Hsa-Mir-616 Mml-Mir-616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054689.2: 55446770-55446832 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCAAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGUCAGGAAUUACCUUAGGUAAUUCCUCCACUCAAAACCCUCCAGUGACUUCCAUGACAUGAAAUAGGAAGUCAUUGGAGGGUUUUGAGCAGAGGAAUGACCUGUUUUAAAAGGCUCACUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGUCAGGAAUUACCUU--| A CA AUGACA AGGU AUUCCUC CUCAAAACCCUCCAGUGACUUCC \ UCCA UAAGGAG GAGUUUUGGGAGGUUACUGAAGG U ACUCACUCGGAAAAUUUUG^ G AC AUAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pab-Mir-616_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAAAACCCUCCAGUGACUUCC -24
Get sequence
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| Star sequence | Pab-Mir-616_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAGUCAUUGGAGGGUUUUGAGCAG -63
Get sequence
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