MirGeneDB ID | Hsa-Mir-616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-616 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-616 Mml-Mir-616 Pab-Mir-616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr12: 57519183-57519244 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUCAAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGUCAGGAAUUACCUUAGGUAAUUCCUCCACUCAAAACCCUUCAGUGACUUCCAUGACAUGAAAUAGGAAGUCAUUGGAGGGUUUGAGCAGAGGAAUGACCUGUUUUAAAAGGCUCACUCAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGUCAGGAAUUACCUU--| A CA A AUGACA AGGU AUUCCUC CUCAAA CCCUUCAGUGACUUCC \ UCCA UAAGGAG GAGUUU GGGAGGUUACUGAAGG U ACUCACUCGGAAAAUUUUG^ G AC - AUAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-616_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCAAAACCCUUCAGUGACUUCC -24
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003284 TargetScanVert: hsa-miR-616-5p TargetMiner: hsa-miR-616-5p miRDB: MIMAT0003284 |
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Star sequence | Hsa-Mir-616_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AAGUCAUUGGAGGGUUUGAGCAG -62
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004805 TargetScanVert: hsa-miR-616-3p TargetMiner: hsa-miR-616-3p miRDB: MIMAT0004805 |