| MirGeneDB ID | Pab-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-378 Cfa-Mir-378 Cja-Mir-378 Cpo-Mir-378 Dno-Mir-378 Eca-Mir-378 Ete-Mir-378 Hsa-Mir-378 Laf-Mir-378 Mml-Mir-378 Mmr-Mir-378-P1 Mmr-Mir-378-P2 Mmr-Mir-378-P3 Mmu-Mir-378 Ocu-Mir-378 Rno-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054683.2: 158363392-158363451 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAGCCAGAGGGUGACAGAGCCACCCAGGGCUCCUGACUCCAGGUCCUGUGUGUUAACUAGAAAUAGCACUGGACUUGGAGUCAGAAGGCCUGAGUGGAGUCACCUUCCCCACUCUCUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCAGCCAGAGGGUGACA- G-| C G C U GUUAAC GA CCAC CAGG CU CUGACUCCAGGUCC GUGU U CU GGUG GUCC GA GACUGAGGUUCAGG CACG A GGUCUCUCACCCCUUCCA GA^ A G A U AUAAAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pab-Mir-378_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pab-Mir-378_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- ACUGGACUUGGAGUCAGAAGGC -60
Get sequence
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