| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-378-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-378-P1 Mmr-Mir-378-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-378 Cfa-Mir-378 Cja-Mir-378 Cpo-Mir-378 Dno-Mir-378 Eca-Mir-378 Ete-Mir-378 Hsa-Mir-378 Laf-Mir-378 Mml-Mir-378 Mmu-Mir-378 Ocu-Mir-378 Pab-Mir-378 Rno-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. murinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007676.1: 18919227-18919312 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACCCCUCACCCCACCCCCACCCCCAGCAUCCUCUGGGCUCUCCCAGUCCAGGCGGUACCCUCAGAGAGGCAGCUCUGGUGUAGAGAAAGGAGCACUGGACUUGGAGUCAGAAGACCUGAGUGUGACCCCCAGCCCAGCCCUUAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UACCCCUCACCCCACCCC---| CCC CA C GCU C - GGUACCCUCAGAGAGGCA CAC CAG UC UCUGG CUCC AGUCCAG GC G GUG GUC AG AGACU GAGG UCAGGUC CG C AUAUUCCCGACCCGACCCCCA^ UGA C- A --- U A AGGAAAGAGAUGUGGUCU 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-378-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCUGGGCUCUCCCAGUCCAGGC -24
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-378-P2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
64- ACUGGACUUGGAGUCAGAAGAC -86
Get sequence
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