MirGeneDB ID | Pab-Mir-324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-324 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-324 Cfa-Mir-324 Cja-Mir-324 Cpo-Mir-324 Dno-Mir-324 Eca-Mir-324 Ete-Mir-324 Hsa-Mir-324 Laf-Mir-324 Mml-Mir-324 Mmr-Mir-324 Mmu-Mir-324 Ocu-Mir-324 Rno-Mir-324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054698.2: 7072981-7073037 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCAUCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUCCAGAAGCUGAGCUGACUAUGCCUCCCCGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGUAAAGCUGGAGACCCACUGCCCCAGGUGCUGCUGGGGGUUGUAGUCUGACCCGACUGGGAAGAAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CUUCCAGAAGCUGAGCU--| GC C UCC A U U AAAG GACUAU CUCCC GCA CCU GGGCA UGG GU C CUGAUG GGGGG CGU GGA CCCGU ACC CA U AAAGAAGGGUCAGCCCAGU^ UU U CGU C C - GAGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pab-Mir-324_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGU -23
Get sequence
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Star sequence | Pab-Mir-324_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG -57
Get sequence
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