| MirGeneDB ID | Ovu-Mir-12521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12521 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Common octopus (Octopus vulgaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Esc-Mir-12521-v1 Obi-Mir-12521-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003957725.1_ASM395772v1_OVU) |
RXHP01029285.1: 1863-1924 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12521-v1) |
Mir-12521-v1
RXHP01029285.1: 1863-1924 [-]
Ensembl
Mir-12521-v2 RXHP01029285.1: 1863-1924 [-] Ensembl Mir-12521-v3 RXHP01029285.1: 1863-1924 [-] Ensembl |
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| Variant | Ovu-Mir-12521-v1 |
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| Seed | UUAGUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAGAUUAGAGUACAAUUCCGAUCGUUAGCUGGUUAUGUGAACUAAGAUUCAUUUCCUUAUCAAAUAUUUAGUGCACAUAACUGGCUGAUGAAUAGAAUUUGUUAUCGUCUCGGAAAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAGAUUAGAGUAC--| CGA UG A AUUCAUUUC AAUUC UCGUUAGC GUUAUGUG ACUAAG C UUAAG AGUAGUCG CAAUACAC UGAUUU U CUAAAGGCUCUGCUAUUGU^ AUA GU G AUAAACUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ovu-Mir-12521-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGGUUAUGUGAACUAAGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ovu-Mir-12521-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUUAGUGCACAUAACUGGCUGA -62
Get sequence
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| Variant | Ovu-Mir-12521-v2 |
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| Seed | UUUAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAGAUUAGAGUACAAUUCCGAUCGUUAGCUGGUUAUGUGAACUAAGAUUCAUUUCCUUAUCAAAUAUUUAGUGCACAUAACUGGCUGAUGAAUAGAAUUUGUUAUCGUCUCGGAAAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAAGAAGAUUAGAGUAC-- CGA UG A -| CAUUUC AAUUC UCGUUAGC GUUAUGUG ACUAAG AUU \ UUAAG AGUAGUCG CAAUACAC UGAUUU UAA C CUAAAGGCUCUGCUAUUGU AUA GU G A^ ACUAUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ovu-Mir-12521-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGGUUAUGUGAACUAAGAUU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Ovu-Mir-12521-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUUUAGUGCACAUAACUGGCUGA -62
Get sequence
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| Variant | Ovu-Mir-12521-v3 |
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| Seed | AUUUAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAGAUUAGAGUACAAUUCCGAUCGUUAGCUGGUUAUGUGAACUAAGAUUCAUUUCCUUAUCAAAUAUUUAGUGCACAUAACUGGCUGAUGAAUAGAAUUUGUUAUCGUCUCGGAAAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAAGAAGAUUAGAGUAC-- CGA UG A -| CAUUUC AAUUC UCGUUAGC GUUAUGUG ACUAAG AUU \ UUAAG AGUAGUCG CAAUACAC UGAUUU UAA C CUAAAGGCUCUGCUAUUGU AUA GU G A^ ACUAUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ovu-Mir-12521-v3_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGGUUAUGUGAACUAAGAUUC -24
Get sequence
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| Mature sequence | Ovu-Mir-12521-v3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAUUUAGUGCACAUAACUGGCUGA -62
Get sequence
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