MirGeneDB ID | Neu-Mir-7392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7392 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7392-P1a Mdo-Mir-7392-P1b Sha-Mir-7392-P2 Sha-Mir-7392-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 62654357-62654413 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7392) |
Mir-7392
CM051820.1: 62654357-62654413 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7394-P1 CM051820.1: 62663877-62663930 [+] UCSC Ensembl Mir-7394-P2 CM051820.1: 62671261-62671314 [+] UCSC Ensembl Mir-7397 CM051820.1: 62674945-62675000 [+] UCSC Ensembl Mir-7394-P3 CM051820.1: 62677964-62678017 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | ACGAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUGAAGUAUCAAAAGUGAGUUGCCCCAGGUACGAGUAUACUUUGGUUACCUGAGUGUACAUGUCAGUAACCUCAGUAUACUUGCUCCUGGUGUACACUUCUCUGUACACAUUCAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCUGAAGUAUCAAAAGUG -| C UA UU C GUGU AGU UGC CCAGG CGAGUAUACU GGUUAC UGA \ UCA AUG GGUCC GUUCAUAUGA CCAAUG ACU A CAACUUACACAUGUCUCU C^ U UC CU - GUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Neu-Mir-7392_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACGAGUAUACUUUGGUUACCUGA -24
Get sequence
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Star sequence | Neu-Mir-7392_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AGUAACCUCAGUAUACUUGCUC -57
Get sequence
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