| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7332 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7332 Sha-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051815.1: 462009414-462009476 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7332) |
Mir-7332
CM051815.1: 462009414-462009476 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-12380 CM051815.1: 462035964-462036019 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUGAAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGACCUUGGAAAUGCCAGUAGUGUGGACCAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUGAAAGAAUCCACUUGGCCUCCUGAAUCAACUGACUGUUGGUCUGCACUAGCUGAAGUCAACGGAAAAUGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUGACCUUGGAAAUGC- -| UG CC A AUGAAAGAAU CAG UAGUG GACCAAUAG UGG UGAUUCAG C GUC AUCAC CUGGUUGUC GUC ACUAAGUC C CGGUAAAAGGCAACUGAA G^ GU A- A CUCCGGUUCA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-7332_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-7332_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CCUGAAUCAACUGACUGUUGGU -63
Get sequence
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