| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7332 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Neu-Mir-7332 Sha-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
6: 214337424-214337486 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7332) |
Mir-12380
6: 214307234-214307289 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7332 6: 214337424-214337486 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUGAAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGACCUUGGAAAUGCCAGCAGUGUGGACCAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUGAAAGAAUCCACUUGGCCUCCUGAAUCAACUGACUGUUGGUCUGCAUUAGCUGAAGUCAACGGAAAAUGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUGACCUUGGAAAUGC- -| UG CC A AUGAAAGAAU CAGC AGUG GACCAAUAG UGG UGAUUCAG C GUCG UUAC CUGGUUGUC GUC ACUAAGUC C CGGUAAAAGGCAACUGAA A^ GU A- A CUCCGGUUCA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7332_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7332-5p |
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7332_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CCUGAAUCAACUGACUGUUGGU -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7332-3p |
