| MirGeneDB ID | Neu-Mir-12366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12366 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-12366-v1 Sha-Mir-12366-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051818.1: 59743997-59744052 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12366-v1) |
Mir-12366-v1
CM051818.1: 59743997-59744052 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-12366-v2 CM051818.1: 59743997-59744052 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Neu-Mir-12366-v1 |
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| Seed | UCAAAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUCUAACGCACCAUAUUCUAAGGUCCCUUCCAGCUCUGACAUUCUAUGAUCUACAUACAUAGGAUCAAAGGAUUCAGAACUGGAUAGGAUCUUAGGGAGAGCAUCCAGUUCAACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCUCUAACGCACCAUAU--| CU C C A ACAU UCUAAGGUCC UCCAG UCUGA AUUCU UGAUCU \ GGAUUCUAGG AGGUC AGACU UAGGA ACUAGG A CCAACUUGACCUACGAGAG^ AU A - A AUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-12366-v1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAGCUCUGACAUUCUAUGAUCU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-12366-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AUCAAAGGAUUCAGAACUGGAU -56
Get sequence
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| Variant | Neu-Mir-12366-v2 |
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| Seed | CAAAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUCUAACGCACCAUAUUCUAAGGUCCCUUCCAGCUCUGACAUUCUAUGAUCUACAUACAUAGGAUCAAAGGAUUCAGAACUGGAUAGGAUCUUAGGGAGAGCAUCCAGUUCAACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCUCUAACGCACCAUAU--| CU C C A UACAU UCUAAGGUCC UCCAG UCUGA AUUCU UGAUC \ GGAUUCUAGG AGGUC AGACU UAGGA ACUAG A CCAACUUGACCUACGAGAG^ AU A - A GAUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-12366-v2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAGCUCUGACAUUCUAUGAUC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-12366-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UCAAAGGAUUCAGAACUGGAU -56
Get sequence
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