| MirGeneDB ID | Mun-Mir-430-o42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mun-Mir-430-o43 Mun-Mir-430-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mml-Mir-430-P42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. unicolor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594633.1: 436877443-436877498 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-o42) |
Mir-430-P1
LR594633.1: 436874137-436874196 [+]
Mir-430-o42 LR594633.1: 436877443-436877498 [+] Mir-430-o43 LR594633.1: 436878010-436878073 [+] Mir-92-P2a LR594633.1: 436879379-436879438 [+] |
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| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGACGGCUGCAUUGUGGAACCUUUGCUUCUUUAACAUGGAGGUACUUUCUGUAUCUAUACGCAAUAAGUGCUUCCCUGUUCUAGGAGCAGGGAAAUCCUGAACCUCAGGUCAUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAGACGGCUGCAUUGUGGAAC--| UU U UCUGUAUC CUUUGCUUCU AACA GGAGGUACUU U GGGACGAGGA UUGU CCUUCGUGAA A UGUACUGGACUCCAAGUCCUAAA^ UC C UAACGCAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mun-Mir-430-o42_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUAACAUGGAGGUACUUUCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Mun-Mir-430-o42_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UAAGUGCUUCCCUGUUCUAGG -56
Get sequence
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