MirGeneDB ID | Mom-Mir-12590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12590 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-12590 Eba-Mir-12590 War-Mir-12590-P1a War-Mir-12590-P1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Aculifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Aculifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010108965.1: 10420-10478 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGGCGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGGAUCAUGUGUGUUGUCGGAUUGCGUGUCCCUUCCUCCGCCCGUUAGAUGGCCUAGUUCAUUGCUUCUGGCGGGCGAAGAAAGAGGCGGGCAUCCAUCACUUUCAACCAAAGCCACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUGGAUCAUGUGUGUUGUC---| U G C C C UGGCCUAG GGAU GC UGUC CUU CU CGCCCGUUAGA \ CCUA CG GCGG GAA GA GCGGGCGGUCU U ACACCGAAACCAACUUUCACUA^ - G A A A UCGUUACU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mom-Mir-12590_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCCUUCCUCCGCCCGUUAGAUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Mom-Mir-12590_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UCUGGCGGGCGAAGAAAGAGGC -59
Get sequence
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