| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-874 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-874 Cfa-Mir-874 Cja-Mir-874 Cpo-Mir-874 Dno-Mir-874 Eca-Mir-874 Ete-Mir-874 Hsa-Mir-874 Laf-Mir-874 Mml-Mir-874 Mmr-Mir-874 Ocu-Mir-874 Pab-Mir-874 Rno-Mir-874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr13: 58023134-58023191 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCCCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUCGGAUGAAUUUUUUGGUGUUAGCCCUGCGGCCCCACGCACCAGGGUAAGAGAGACUCACUUCCUGCCCUGGCCCGAGGGACCGACUGGCUGGGCCUGCUUUCUGCCCAGCUCACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUUCGGAUGAAUUUUUU---| G CUG C A CA A GAGA GGU UUAGCC CGG CCC CG CCAGGGUA GA C CCG GGUCGG GCC GGG GC GGUCCCGU CU U CCACUCGACCCGUCUUUCGU^ - UCA A A CC C UCAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-874_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017268 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGCCCCACGCACCAGGGUAAGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-874-5p miRDB: MIMAT0017268 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-874_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CUGCCCUGGCCCGAGGGACCGAC -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004853 TargetScanVert: mmu-miR-874-3p miRDB: MIMAT0004853 |
