MirGeneDB ID | Mmr-Mir-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-511 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-511 Cpo-Mir-511 Hsa-Mir-511 Mml-Mir-511 Mmu-Mir-511 Pab-Mir-511 Rno-Mir-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007685.1: 12345581-12345641 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGUCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAUCCAACAAUAAGAAAACAAAUAGACAUCGUGUCUUUCACUGUGCAGUCAGUAGAUACUUAUUUGCGAAUGUGUAGCAAAAGACAGAAUGGGAGUCUAUUAAAUCUCAAGGAUGAGCACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGAUCCAACAAUAAGAAAACA A- ---| CA UG G AGUAGAUA AAUAGAC UCG UGUCUUU CUG CA UC \ UUAUCUG GGU ACAGAAA GAU GU AG C CACGAGUAGGAACUCUAAA-- AG AAG^ AC GU A CGUUUAUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-511_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUGUCUUUCACUGUGCAGUCA -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Mmr-Mir-511_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AAUGUGUAGCAAAAGACAGAAU -61
Get sequence
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