MirGeneDB ID | Mmr-Mir-4677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-4677 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-4677 Hsa-Mir-4677 Mml-Mir-4677 Pab-Mir-4677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007677.1: 42803999-42804057 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGUAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUGGAUGAUUUGGAGUAGCAAAGAAGCAAUUGUUCUUUGGUCUUUCAGCCAUGACCUGACCUUCUGUCUGUAAGACCAGAGAGCUACUUUGCUUGGCCACCAUCUGCACUCAAGAGAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAUGGAUGAUUUGGAGU--------| A AAUUGU U C UGACCU AGCAAAG AGC UCUUUGGUCUU CAG CA \ UCGUUUC UCG AGAGACCAGAA GUC GU G GAGAGAACUCACGUCUACCACCGGU^ A ------ U U CUUCCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-4677_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUGUUCUUUGGUCUUUCAGCCA -22
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-4677_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UCUGUAAGACCAGAGAGCUACU -59
Get sequence
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