MirGeneDB ID | Mmr-Mir-3140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3140 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-3140 Hsa-Mir-3140 Mml-Mir-3140 Pab-Mir-3140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007674.1: 51402554-51402623 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCUUUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAAAUCUAGUAUUCGUGUACUCUUGAGGUACCUGAAUUCUCAAAAGCUUUAUGUGUUCUGAAGUUAAUUGAAAAUAAGACCUUUUGGGAAUUCAGGUAGUUCAGGAGUGACCUUUCUAAAAAACAGACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAAAUCUAGUAUUCGUG--| G C AUGUGUUCUGAA UACUCUUGAG UACCUGAAUUCUCAAAAG UUU G GUGAGGACUU AUGGACUUAAGGGUUUUC AGA U CCAGACAAAAAAUCUUUCCA^ G C AUAAAAGUUAAU . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-3140_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCUGAAUUCUCAAAAGCUUU -21
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-3140_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
49- ACCUUUUGGGAAUUCAGGUAG -70
Get sequence
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