MirGeneDB ID | Mml-Mir-3140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3140 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-3140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-3140 Hsa-Mir-3140 Mmr-Mir-3140 Pab-Mir-3140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014340.1: 150135757-150135823 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCUUUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAAGCCUACCAUUUGUGUCCUCUUGAGGUACCUGAAUUACCAAAAGCUAUGUAUUCUGAAGUUAUUGAAAAUAAGAGCUUUUGGGAAUUCAGGUAGUUCAGGAGUGACUUUUCUAAAAAACAGACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GGAAGCCUACCAUUUGU- -| G A AUGUAUUCUGAAG GUC CUCUUGAG UACCUGAAUU CCAAAAGCU \ CAG GAGGACUU AUGGACUUAA GGUUUUCGA U CCAGACAAAAAAUCUUUU U^ G G GAAUAAAAGUUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-3140_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCUGAAUUACCAAAAGCUAU -21
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-3140_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0024347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
46- AGCUUUUGGGAAUUCAGGUAG -67
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-3140 |