| MirGeneDB ID | Mml-Mir-556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-556 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-556-P1 Cja-Mir-556-P2 Hsa-Mir-556 Pab-Mir-556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014336.1: 88633797-88633856 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUAGGAGUUCAUGAAGAUAGUAAUGAGAAAGAUGAACUCAUUGUAAUAUGAGCUUCAUUUAUGCAUUUCAUAUUACAAUUAGCUGAUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACUACCUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUAGGAGUUCAUGAAGAUAGUAAU--| GAA C GCUUCAU GAGAAAGAU CU AUUGUAAUAUGA U UUUUUUCUA GA UAACAUUAUACU U CUUCCAUCAUUUUUUUUUUUUUUUUU^ GUC U UUACGUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comment | This is a potential pseudogene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-556_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0006424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAUGAACUCAUUGUAAUAUGA -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-556-5p |
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| Co-mature sequence | Mml-Mir-556_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0006425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUAUUACAAUUAGCUGAUCUU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-556-3p |
