MirGeneDB ID | Mml-Mir-498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-498 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUCAAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr19: 49021712-49021771 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-498) |
Mir-430-P8
chr19: 49015081-49015138 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1323 chr19: 49019644-49019699 [+] UCSC Ensembl Mir-498 chr19: 49021712-49021771 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P9c chr19: 49028325-49028387 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P28 chr19: 49030126-49030186 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P21 chr19: 49034618-49034677 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P47 chr19: 49038964-49039022 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P18 chr19: 49039776-49039836 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 chr19: 49042159-49042219 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P42 chr19: 49043006-49043064 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14 chr19: 49044975-49045033 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P26b chr19: 49046148-49046208 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P10 chr19: 49048508-49048566 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P26a chr19: 49053892-49053952 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P11a chr19: 49056095-49056153 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P43 chr19: 49057961-49058020 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35d chr19: 49059976-49060036 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 49061125-49061189 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24a2 chr19: 49066431-49066490 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27 chr19: 49068476-49068541 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUCCUUGGGAAGUGAAGCUCAGGCUGUGAUUUCAAGCCAGGGGGCGUUUUUCUGUGACUGGAUGAAAAGCACCUCCGGGGCUUGAAGCUCACAGUUUGAGAGCAAUCAUCUAAGGAAGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCUCCUUGGGAAGUGAAG- - A-| C UGUGA CUCAGGCUGUGA UUUCAAGCC GGGGG GUUUUUC \ GAGUUUGACACU GAAGUUCGG CCUCC CGAAAAG C UGAAGGAAUCUACUAACGA C GG^ A UAGGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-498_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUCAAGCCAGGGGGCGUUUUUC -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-498 |
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Star sequence | Mml-Mir-498_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AAAGCACCUCCGGGGCUUGAAGCU -60
Get sequence
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