| MirGeneDB ID | Mml-Mir-3173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3173 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-3173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-3173 Hsa-Mir-3173 Pab-Mir-3173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014342.1: 157325189-157325249 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAGAAUUUGUUGGUCUUGGGCCAGCUUCCCUGCCCUGCCUGUUUUCUUCUUUGUGGUUUUAUGAAAGCGAAGGAGGAAACAGGCAGGCCAGGGAAGCGCUCUCUACCUCCCUCGCUGUCUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UAGAAUUUGUUGGUCUU---| CA C UGGUUU GGGC GCUUCCCUG CCUGCCUGUUUUCUUCUUUG U CUCG CGAAGGGAC GGACGGACAAAGGAGGAAGC A UUCUGUCGCUCCCUCCAUCU^ -- C GAAAGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-3173_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCCCUGCCUGUUUUCUUCUUUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mml-Mir-3173_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAGGAGGAAACAGGCAGGCCAG -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-3173 |
