| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7360-P3h | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7360 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7360-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mdo-Mir-7360-P1a Mdo-Mir-7360-P1b Mdo-Mir-7360-P1c Mdo-Mir-7360-P1d Mdo-Mir-7360-P1e Mdo-Mir-7360-P1f Mdo-Mir-7360-P2a Mdo-Mir-7360-P2b Mdo-Mir-7360-P2c Mdo-Mir-7360-P2d Mdo-Mir-7360-P3a Mdo-Mir-7360-P3b Mdo-Mir-7360-P3c Mdo-Mir-7360-P3d Mdo-Mir-7360-P3e Mdo-Mir-7360-P3f Mdo-Mir-7360-P3g Mdo-Mir-7360-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
Un: 75566443-75566501 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7360-P3h) |
Mir-7360-P3h
Un: 75566443-75566501 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7360-P3g Un: 75570507-75570565 [-] UCSC Ensembl Mir-7360-P1f Un: 75571873-75571931 [-] UCSC Ensembl Mir-7360-P3f Un: 75573205-75573263 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAUUGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGGGGUAUUAGGAGGUUCUGAGGUCCCAUUCCUUUCUGUAGGUAUAAUAUUUUAAUAAAAAAUUAAAUAUUGUAUCACAGAUUGGACUGGGCCCUUUGACCAAUCAUCAUCAACUUAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGGGGUAUUAGGAGGU--| U U U UU A UAAUA UC GAGG CCCA UCC UCUGU GGUAUAAUAUUU A AG UUCC GGGU AGG AGACA CUAUGUUAUAAA A GAUUCAACUACUACUAACC^ U C C UU - UUAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7360-P3h_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0028732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUUUCUGUAGGUAUAAUAUUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7360-5p |
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7360-P3h_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028733 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUAUUGUAUCACAGAUUGGACU -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7360-3p |
