MirGeneDB ID | Mal-Mir-184-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGACGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mal-Mir-184-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-184 Aca-Mir-184 Ami-Mir-184 Asu-Mir-184 Bfl-Mir-184 Bge-Mir-184 Bla-Mir-184 Bpl-Mir-184 Bta-Mir-184 Cfa-Mir-184 Cin-Mir-184 Cli-Mir-184 Cmi-Mir-184 Cpi-Mir-184 Cpo-Mir-184 Dan-Mir-184 Dma-Mir-184 Dme-Mir-184 Dmo-Mir-184 Dno-Mir-184 Dpu-Mir-184 Dre-Mir-184-P1 Dsi-Mir-184 Dya-Mir-184 Efe-Mir-184-o1 Esc-Mir-184 Ete-Mir-184 Gga-Mir-184 Gja-Mir-184 Gmo-Mir-184-P1 Hme-Mir-184 Hsa-Mir-184 Isc-Mir-184 Lan-Mir-184 Lch-Mir-184 Loc-Mir-184 Mdo-Mir-184 Mml-Mir-184 Mmu-Mir-184 Npo-Mir-184 Oan-Mir-184 Ocu-Mir-184 Pbv-Mir-184 Pfl-Mir-184 Pma-Mir-184 Pmi-Mir-184 Rno-Mir-184 Sha-Mir-184 Sko-Mir-184 Spt-Mir-184 Spu-Mir-184 Sto-Mir-184 Tca-Mir-184 Tgu-Mir-184 Tni-Mir-184-P1 Xtr-Mir-184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884693.1: 2124865-2124927 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUUCAGGUUAUAAUGCUGUUGAGCACAUCUCCUCAUCACUUUUCCAGCCCAGCUAUCUAUCAAAUGUUUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAUGUGUCUGACACUUUCCAUCACUGAUAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GUUCAGGUUAUAAUGCU--| GA CU C C AGC UAUCUAU GUU GCACAU CCU AUCA UUUUCC CCAGC C CAG UGUGUA GGA UAGU AAGAGG GGUUG A CAAUAGUCACUACCUUUCA^ UC UG A C CA- UUUGUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mal-Mir-184-P1_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAUCACUUUUCCAGCCCAGC -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mal-Mir-184-P1_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- UGGACGGAGAACUGAUAAGGGU -63
Get sequence
|