MirGeneDB ID | Hsa-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-582 Eca-Mir-582 Ocu-Mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr5: 59703630-59703687 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v2) |
Mir-582-v1
chr5: 59703629-59703688 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 chr5: 59703630-59703687 [-] UCSC Ensembl |
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Variant | Hsa-Mir-582-v2 |
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Seed | ACAGUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCACAACAAGUCAAUCUGUGCUCUUUGAUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACUAAUUGUAACUGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCAUUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACCACAACAAGUCAAUC--| UG AUUA UAAUCU UG CUCUUUG CAGUUGUUCAACCAGUUAC A AC GGGAAAC GUCAACAAGUUGGUCAAUG A GUUACUUUACAAAGAUGAA^ GU CCAA UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-582-v2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
|
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003247 TargetScanVert: hsa-miR-582-5p TargetMiner: hsa-miR-582-5p miRDB: MIMAT0003247 |
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Star sequence | Hsa-Mir-582-v2_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAACUGGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
|
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004797 TargetScanVert: hsa-miR-582-3p TargetMiner: hsa-miR-582-3p miRDB: MIMAT0004797 |
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Variant | Hsa-Mir-582-v1 |
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Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACCACAACAAGUCAAUCUGUGCUCUUUGAUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAACUAAUUGUAACUGGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUAGAAACAUUUCAUUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GACCACAACAAGUCAAUC--| UG AUUA UAAUCU UG CUCUUUG CAGUUGUUCAACCAGUUAC A AC GGGAAAC GUCAACAAGUUGGUCAAUG A UGUUACUUUACAAAGAUGAA^ GU CCAA UUAAUC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-582-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUAC -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003247 TargetScanVert: hsa-miR-582-5p TargetMiner: hsa-miR-582-5p miRDB: MIMAT0003247 |
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Star sequence | Hsa-Mir-582-v1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AACUGGUUGAACAACUGAACCC -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004797 TargetScanVert: hsa-miR-582-3p TargetMiner: hsa-miR-582-3p miRDB: MIMAT0004797 |